Ученые МГУ составили новую карту регуляции генов человека
Международная группа исследователей, включающая ученых МГУ имени М. В. Ломоносова, составила карту регуляции генов человека, описывающую особенности связывания ДНК со 177 регуляторными белками. Это открытие позволит точнее оценивать, как генетические мутации приводят к заболеваниям, сообщила пресс-служба вуза.
Полученный каталог дает возможность предсказывать, с какими участками генома связывается тот или иной регуляторный белок и как на это связывание влияют отдельные мутации. Исследование ученых из России, Канады, Швейцарии, США и Германии существенно дополняет карту управления генами человека, а его результаты опубликованы в журнале Nature.
Участники международного проекта Codebook/GRECO-BIT использовали пять независимых методов, чтобы определить специфичность белков в пробирках и в живых клетках. Каждую построенную модель связывания проверяли на данных, полученных другими методами для того же белка. В общей сложности им удалось описать паттерны для 177 новых белков.
Codebook/GRECO-BIT — это масштабная международная коллаборация в области биоинформатики и молекулярной биологии, направленная на изучение специфичности связывания транскрипционных факторов с ДНК. Проект собирает экспериментальные данные и разрабатывает компьютерные методы, чтобы понять, какие именно участки ДНК распознает каждый такой белок. Это помогает лучше понимать работу генов, исследовать причины наследственных заболеваний, разрабатывать новые методы диагностики и лечения.
Как отметили ученые, ценность проведенных опытов заключается не только в покрытии множества малоисследованных факторов транскрипции, но и в их систематичности. Геномные паттерны связывания регуляторного белка могут очень сильно отличаться от связывания с искусственными последовательностями. Эти данные — один из немногих наборов, которые позволяют создавать универсальные модели связывания, в том числе модели искусственного интеллекта, способные к качественному и оцениваемому переносу знаний.
